MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017817	GCA	3	9	59	67	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858973
2	NC_017817	AATT	2	8	139	146	50 %	50 %	0 %	0 %	386858973
3	NC_017817	TAA	2	6	171	176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
4	NC_017817	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858973
5	NC_017817	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
6	NC_017817	TCC	2	6	340	345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858973
7	NC_017817	AAG	2	6	360	365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858973
8	NC_017817	ATTC	2	8	381	388	25 %	50 %	0 %	25 %	386858973
9	NC_017817	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858973
10	NC_017817	CT	3	6	428	433	0 %	50 %	0 %	50 %	386858973
11	NC_017817	CATCAC	2	12	469	480	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858973
12	NC_017817	CAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858973
13	NC_017817	CT	3	6	507	512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017817	CTT	2	6	527	532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017817	TC	3	6	533	538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017817	CCT	2	6	554	559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017817	T	7	7	562	568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017817	T	7	7	574	580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017817	TAA	2	6	591	596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017817	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017817	ACA	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017817	AG	3	6	648	653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017817	CT	3	6	662	667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017817	ATAA	2	8	702	709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017817	CT	3	6	742	747	0 %	50 %	0 %	50 %	386858974
26	NC_017817	CTT	2	6	759	764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
27	NC_017817	TCT	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
28	NC_017817	TCT	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
29	NC_017817	AAC	2	6	824	829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
30	NC_017817	CTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
31	NC_017817	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858974
32	NC_017817	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
33	NC_017817	CTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
34	NC_017817	AAC	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858974
35	NC_017817	CACT	2	8	936	943	25 %	25 %	0 %	50 %	386858974
36	NC_017817	TCC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858974
37	NC_017817	TCT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
38	NC_017817	TCTCC	2	10	1083	1092	0 %	40 %	0 %	60 %	386858974
39	NC_017817	TGC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
40	NC_017817	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
41	NC_017817	CACTTG	2	12	1218	1229	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386858974
42	NC_017817	TA	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	386858974
43	NC_017817	CTT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
44	NC_017817	CTG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858974
45	NC_017817	T	6	6	1521	1526	0 %	100 %	0 %	0 %	386858974
46	NC_017817	TCT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858974
47	NC_017817	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	386858974
48	NC_017817	C	6	6	1632	1637	0 %	0 %	0 %	100 %	386858975
49	NC_017817	CTT	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
50	NC_017817	CAG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858975
51	NC_017817	CTC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
52	NC_017817	CTC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
53	NC_017817	TTCC	2	8	1703	1710	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
54	NC_017817	CAC	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858975
55	NC_017817	ATT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858975
56	NC_017817	CT	5	10	1802	1811	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
57	NC_017817	CT	4	8	1814	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	386858975
58	NC_017817	TCT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
59	NC_017817	TCT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858975
60	NC_017817	ATTTTC	2	12	1849	1860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858975
61	NC_017817	CCT	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858975
62	NC_017817	T	7	7	1879	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	386858975
63	NC_017817	CAAA	3	12	1898	1909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017817	AAAT	2	8	1910	1917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017817	GAAT	2	8	1930	1937	50 %	25 %	25 %	0 %	386858976
66	NC_017817	TAA	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858976
67	NC_017817	TTATT	2	10	2075	2084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017817	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
69	NC_017817	ACT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
70	NC_017817	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
71	NC_017817	CTT	2	6	2210	2215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858977
72	NC_017817	TTG	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858977
73	NC_017817	AGC	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
74	NC_017817	ACC	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858977
75	NC_017817	CAT	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
76	NC_017817	AT	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858977
77	NC_017817	CTC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
78	NC_017817	CTC	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858977
79	NC_017817	TGC	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858977
80	NC_017817	CTTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	386858977
81	NC_017817	TAG	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858977
82	NC_017817	CAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
83	NC_017817	CAG	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
84	NC_017817	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858977
85	NC_017817	TCACCA	2	12	2564	2575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858977
86	NC_017817	CAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
87	NC_017817	GCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858977
88	NC_017817	TTA	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858977
89	NC_017817	TAC	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
90	NC_017817	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858977
91	NC_017817	TCT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017817	ACA	2	6	2705	2710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017817	CCA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017817	CAG	3	9	2721	2729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017817	AGT	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017817	TCA	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017817	CCT	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017817	TAT	2	6	2794	2799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017817	N	248	248	2812	3059	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017817	CT	3	6	3085	3090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017817	TTCTT	2	10	3109	3118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017817	TTCAT	2	10	3121	3130	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017817	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017817	CTT	2	6	3180	3185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017817	ATG	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017817	TTAC	2	8	3283	3290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017817	TCCT	2	8	3321	3328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017817	CAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
109	NC_017817	CAT	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
110	NC_017817	ATT	3	9	3388	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858978
111	NC_017817	ACT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858978
112	NC_017817	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858978
113	NC_017817	TC	3	6	3431	3436	0 %	50 %	0 %	50 %	386858978
114	NC_017817	CCT	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858978
115	NC_017817	T	7	7	3460	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
116	NC_017817	CTTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	386858978
117	NC_017817	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	386858978
118	NC_017817	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	386858978
119	NC_017817	AAAT	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	386858978
120	NC_017817	TA	3	6	3528	3533	50 %	50 %	0 %	0 %	386858978
121	NC_017817	A	6	6	3554	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017817	CTT	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017817	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017817	AT	3	6	3616	3621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017817	AAT	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017817	TC	3	6	3674	3679	0 %	50 %	0 %	50 %	386858979
127	NC_017817	TTAT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	386858979
128	NC_017817	TGC	2	6	3792	3797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
129	NC_017817	AGC	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858979
130	NC_017817	ACC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858979
131	NC_017817	GCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
132	NC_017817	ATA	2	6	3865	3870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858979
133	NC_017817	T	7	7	3876	3882	0 %	100 %	0 %	0 %	386858979
134	NC_017817	TAT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858979
135	NC_017817	CTT	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858979
136	NC_017817	CTG	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
137	NC_017817	TGC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858979
138	NC_017817	TAG	2	6	3956	3961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858979
139	NC_017817	CAGAAA	2	12	3980	3991	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386858979
140	NC_017817	AT	3	6	4001	4006	50 %	50 %	0 %	0 %	386858979
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451	NC_017817	AAC	2	6	17418	17423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_017817	GAA	2	6	17447	17452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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